ড. আনু মাহ্‌মুদ স্কুল ও কলেজের শিক্ষা জীবন তার জন্মস্থান পটুয়াখালীতে সম্পন্ন করেন এবং সরকারী জুবিলী উচ্চ বিদ্যালয় থেকে এস এস সি এবং পটুয়াখালী সরকারী কলেজ থেকে এইচ এস সি পরীক্ষায় কৃতিত্বের সাথে উত্তীর্ণ হন। ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয় থেকে অর্থনীতিতে সম্মানসহ স্মাতোকোত্তর ডিগ্রি অর্জন করেন।